前往可可西里地区一般总是经由西宁到达格尔木市，然后乘专车由青藏公路越过昆仑山口，择路进入可可西里腹地。也有人从西藏拉萨市经唐古拉山口后进入可可西里，但由于目前进入保护区腹地须经有关部门批准，办理相应手续，颇不方便。

不冻泉保护站位于昆仑山口以南20公里处，距格尔木市180公里。楚玛尔河保护站位于109国道楚玛尔河大桥以北20多公里处，距格尔木240公里。五道梁保护站位于109国道3007公里处，距格尔木270公里。沱沱河保护站位于109国道3120公里处，距格尔木390多公里。卓乃湖保护点距109国道150多公里，距格尔木430多公里。索南达杰保护站昆仑山口和五道梁之间青藏公路2952公里处，距离格尔木210公里。